DNA sünteesi efektiivsust määravad tegurid

Tüüpilises DNA, RNA ja mittelooduslike nukleiinhapete sünteesis mängib kaitse eemaldamise ja sidumise etapp otsustavat rolli.

Kaitse eemaldamise etapis eemaldatakse tahkel kandjal DMT rühm või eelmisel nukleosiidil 5' hüdroksüülrühm orgaanilise happega ja hüdroksüülrühm eksponeeritakse järgmise sidestusetapi jaoks.Kaitserühma eemaldamise etapis kasutatakse enamasti 3% trikloroäädikhapet diklorometaanis või tolueenis.Trikloroäädikhappe kontsentratsioon ja kaitse eemaldamise aeg (deblokeerimisaeg) domineerivad lõpptoodete puhtuse üle.Madal kontsentratsioon ja ebapiisav deblokeerimisaeg jätab DMT rühma reageerimata, mis vähendab saagist ja suurendab soovimatute lisandite hulka.Pikk deblokeerimisaeg võib viia sünteesitud järjestuste depuriinini, moodustades ootamatuid lisandeid.

Ühendusaste on tundlik lahustite veesisalduse ja õhuniiskuse suhtes.Vee kontsentratsioon sünteesis peaks olema alla 40 ppm, parem alla 25 ppm.Veevaba sünteesi tingimuste säilitamiseks tuleks nukleiinhapete süntees läbi viia madala õhuniiskusega keskkonnas, seega soovitame oma kliendil kasutadaAmidiitidest lahustatud seadmed, mis võib pulbrilise või õlise fosforamidiidi lahustada veevabas atsetonitriilis, et vältida kokkupuudet õhuga.

DNA sünteesi efektiivsust määravad tegurid5
DNA sünteesi efektiivsust määravad tegurid4

Kuna fosforamidiidid lahustuvad paremini veevabas olukorras ja molekulaarsed püünised adsorbeerivad reagentides ja amidiidis olevat vett, on vaja ette valmistadaMolekulaarsed lõksud.Soovitame 2 g sõela 50-250 ml reaktiivipudelite jaoks, 5 g 250-500 ml reaktiivipudelite jaoks, 10 g 500-1000 ml reaktiivipudelite jaoks ja 20 g 1000-2000 ml reaktiivipudelite jaoks.

Fosforamidiitide lahustamine peaks toimuma inertses atmosfääris ning aktivaatorreaktiivide ja atsetonitriili asendamine peaks olema õigeaegselt lõpetatud.Korkimis- ja oksüdeerimisreagendid tuleks ära kasutada nii kiiresti kui võimalik, avatud reaktiivid annavad vähem säilivusaega ja vähem aktiivsust sünteesi ajal.


Postitusaeg: august 09-2022